Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Lgr5Q9Z1P4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Lgr5Q9Z1P4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Lgr5Q9Z1P4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Lgr5Q9Z1P4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Lgr5Q9Z1P4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Lgr5Q9Z1P4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Lgr5Q9Z1P4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Lgr5Q9Z1P4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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