Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Trpc2Q9R244 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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Trpc2Q9R244 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpc2Q9R244 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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