Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf7Q9R1C0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms