Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rnf4Q9QZS2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms