Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms