Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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ChmQ9QXG2 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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ChmQ9QXG2 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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ChmQ9QXG2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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ChmQ9QXG2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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