Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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