Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
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SacsQ9JLC8 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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SacsQ9JLC8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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SacsQ9JLC8 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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SacsQ9JLC8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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SacsQ9JLC8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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SacsQ9JLC8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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SacsQ9JLC8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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SacsQ9JLC8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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SacsQ9JLC8 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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SacsQ9JLC8 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
SacsQ9JLC8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms