Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Tuba8Q9JJZ2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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Tuba8Q9JJZ2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Tuba8Q9JJZ2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Tuba8Q9JJZ2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Tuba8Q9JJZ2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
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Tuba8Q9JJZ2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Tuba8Q9JJZ2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Tuba8Q9JJZ2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tuba8Q9JJZ2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tuba8Q9JJZ2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tuba8Q9JJZ2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tuba8Q9JJZ2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tuba8Q9JJZ2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tuba8Q9JJZ2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tuba8Q9JJZ2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tuba8Q9JJZ2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tuba8Q9JJZ2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tuba8Q9JJZ2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tuba8Q9JJZ2 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tuba8Q9JJZ2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tuba8Q9JJZ2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tuba8Q9JJZ2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tuba8Q9JJZ2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tuba8Q9JJZ2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tuba8Q9JJZ2 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tuba8Q9JJZ2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tuba8Q9JJZ2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tuba8Q9JJZ2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tuba8Q9JJZ2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tuba8Q9JJZ2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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