Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3bQ9ES34 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3bQ9ES34 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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