Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn2Q9ER65 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms