Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Smg9Q9DB90 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Smg9Q9DB90 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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