Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D9S1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D9S1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D9S1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D9S1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms