Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn22Q9D7U6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms