Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rep15Q9D7T1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rep15Q9D7T1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rep15Q9D7T1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rep15Q9D7T1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rep15Q9D7T1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rep15Q9D7T1 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rep15Q9D7T1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rep15Q9D7T1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rep15Q9D7T1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rep15Q9D7T1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rep15Q9D7T1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rep15Q9D7T1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Rep15Q9D7T1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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