Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc94Q9D6J3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms