Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gcc1Q9D4H2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms