Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgms2Q9D4B1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgms2Q9D4B1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgms2Q9D4B1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgms2Q9D4B1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgms2Q9D4B1 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgms2Q9D4B1 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgms2Q9D4B1 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgms2Q9D4B1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgms2Q9D4B1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgms2Q9D4B1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgms2Q9D4B1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgms2Q9D4B1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgms2Q9D4B1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgms2Q9D4B1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgms2Q9D4B1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgms2Q9D4B1 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgms2Q9D4B1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgms2Q9D4B1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgms2Q9D4B1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgms2Q9D4B1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgms2Q9D4B1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgms2Q9D4B1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sgms2Q9D4B1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms