Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms