Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snx7Q9CY18 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Snx7Q9CY18 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Snx7Q9CY18 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Snx7Q9CY18 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snx7Q9CY18 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms