Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PsenenQ9CQR7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms