Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccer1Q9CQL2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms