Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI3

Gmfb, Glia maturation factor beta, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmfbQ9CQI3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GmfbQ9CQI3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms