Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Atp6v0e1Q9CQD8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Atp6v0e1Q9CQD8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Atp6v0e1Q9CQD8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Atp6v0e1Q9CQD8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Atp6v0e1Q9CQD8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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