Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab5aQ9CQD1 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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