Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Bhlhe41Q99PV5 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bhlhe41Q99PV5 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms