Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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