Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gtf2ird2Q99NI3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gtf2ird2Q99NI3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gtf2ird2Q99NI3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gtf2ird2Q99NI3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Gtf2ird2Q99NI3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf2ird2Q99NI3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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