Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac9Q99N13 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms