Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp16Q99LG0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms