Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp11Q99K46 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp11Q99K46 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp11Q99K46 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp11Q99K46 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp11Q99K46 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usp11Q99K46 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp11Q99K46 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp11Q99K46 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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