Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Higd1bQ99JY6 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Higd1bQ99JY6 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Higd1bQ99JY6 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Higd1bQ99JY6 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Higd1bQ99JY6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Higd1bQ99JY6 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Higd1bQ99JY6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Higd1bQ99JY6 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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