Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CsprsQ99388 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms