Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Smg8Q8VE18 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Smg8Q8VE18 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Smg8Q8VE18 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Smg8Q8VE18 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Smg8Q8VE18 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Smg8Q8VE18 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Smg8Q8VE18 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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