Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn4Q8VCH8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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