Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
RfxapQ8VCG9 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
RfxapQ8VCG9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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