Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Hoxc12Q8K5B8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Hoxc12Q8K5B8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Hoxc12Q8K5B8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Hoxc12Q8K5B8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Hoxc12Q8K5B8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Hoxc12Q8K5B8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Hoxc12Q8K5B8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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