Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Nek9Q8K1R7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms