Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Znf628Q8CJ78 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Znf628Q8CJ78 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Znf628Q8CJ78 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Znf628Q8CJ78 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Znf628Q8CJ78 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Znf628Q8CJ78 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Znf628Q8CJ78 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Znf628Q8CJ78 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Znf628Q8CJ78 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Znf628Q8CJ78 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Znf628Q8CJ78 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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