Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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SbsnQ8CIT9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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SbsnQ8CIT9 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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SbsnQ8CIT9 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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SbsnQ8CIT9 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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SbsnQ8CIT9 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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SbsnQ8CIT9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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SbsnQ8CIT9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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SbsnQ8CIT9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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SbsnQ8CIT9 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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