Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tshz3Q8CGV9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Tshz3Q8CGV9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Tshz3Q8CGV9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Tshz3Q8CGV9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tshz3Q8CGV9 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tshz3Q8CGV9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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