Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms