Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hpf1Q8CFE2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Hpf1Q8CFE2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Hpf1Q8CFE2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Hpf1Q8CFE2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Hpf1Q8CFE2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Hpf1Q8CFE2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Hpf1Q8CFE2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Hpf1Q8CFE2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Hpf1Q8CFE2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Hpf1Q8CFE2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Hpf1Q8CFE2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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