Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Usp27Q8CEG8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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