Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Cops7bQ8BV13 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cops7bQ8BV13 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cops7bQ8BV13 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cops7bQ8BV13 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cops7bQ8BV13 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms