Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gpc2Q8BKV1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gpc2Q8BKV1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gpc2Q8BKV1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gpc2Q8BKV1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gpc2Q8BKV1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gpc2Q8BKV1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gpc2Q8BKV1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gpc2Q8BKV1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gpc2Q8BKV1 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gpc2Q8BKV1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gpc2Q8BKV1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gpc2Q8BKV1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gpc2Q8BKV1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gpc2Q8BKV1 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gpc2Q8BKV1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gpc2Q8BKV1 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gpc2Q8BKV1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gpc2Q8BKV1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gpc2Q8BKV1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gpc2Q8BKV1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gpc2Q8BKV1 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gpc2Q8BKV1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc2Q8BKV1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc2Q8BKV1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc2Q8BKV1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc2Q8BKV1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc2Q8BKV1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc2Q8BKV1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc2Q8BKV1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc2Q8BKV1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc2Q8BKV1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc2Q8BKV1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gpc2Q8BKV1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gpc2Q8BKV1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gpc2Q8BKV1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gpc2Q8BKV1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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