Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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H2-M10.6Q85ZW5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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H2-M10.6Q85ZW5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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H2-M10.6Q85ZW5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-M10.6Q85ZW5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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