Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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