Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms