Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Usp17leQ7M764 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp17leQ7M764 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp17leQ7M764 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp17leQ7M764 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17leQ7M764 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17leQ7M764 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp17leQ7M764 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17leQ7M764 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17leQ7M764 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp17leQ7M764 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17leQ7M764 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp17leQ7M764 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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